Le Conseil U.I.S. est l'organe de décisions de la CFDT Pays Basque. Il est composé de représentants des syndicats CFDT élus lors du Congrès de l'U.I.S.

Il décide de l'organisation générale, de la politique de la CFDT Pays Basque. C'est un organe délibératif.

Le Bureau U.I.S. est chargé d'appliquer les décisions du Conseil.